Los gérmenes comunes proceden de los residuos fecales (enterobacterias). El Escherichia Coli, es el responsable del 85 por ciento de las infecciones no complicadas en mujeres sexualmente activas, del 70 por ciento de las infecciones no complicadas del adulto y del 50 por ciento de las infecciones hospitalarias. Otros gérmenes más comunes son: Proteus, Klebsiella, Enterobacter, Citrobacter, Pseudomona, Serratia, Estafilococo Estreptococo Faucalis y especialmente el, Stafilococo Saprofíticus (15 por ciento de las infecciones en mujeres sexualmente activas).\cite{CUN}
Algunas bacterias o levadura de la parte baja del tracto recta o gastrointestinal tienen la posibilidad de entrar al tracto urinario generalmente por la uretra. Cuando las bacterias se pegan a la uretra se pueden pegar a la uretra y multiplicarse hasta infectar incluso si la bacteria viaja hacia arriba puede infectar la vejiga provocando la cistitis.\cite{taylorcistitis}
La mayoría de los casos de cistitis se causa por las bacterias del área rectal. En mujeres el área rectal está muy cerca de la uretra, esto provoca que las bacterias viajen fácilmente a la uretra. Otra causa son las relaciones sexuales, en mujeres después de tener un periodo sexual activo se puede presentar la cistitis porque la bacteria pudo entrar a la uretra durante el sexo.\cite{taylorcistitis}
En México, de acuerdo al Boletín epidemiológico de la dirección general de Epidemiologia, en 2015 fueron registrados más de tres millones de casos de infecciones en vías urinarias en mujeres y 951 mil 771 en hombres. La especialista Torres Ochoa indico que la causa de estas infecciones son el sobrecrecimiento de las bacterias benignas que se encuentran en el tracto urinario lo cual se conforma por, riñones, utrero, vejiga, uretra y en el caso de los hombres la próstata. Como consecuencia de no ser tratados adecuadamente o aplicar un tratamiento, los microorganismos pueden migrar al riñón y convertirse en un absceso renal.\cite{GobMex}
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